برخی برنامه‌ها و راهبردهای این معاونت به شرح زیر می‌باشند :

• توسعه و تقويت استقلال مالي دانشگاه و واحدهای تابعه
• ساماندهي كاركنان و توانمندسازی آنان
• بهبود و بهینه‌سازی سرانه فضاهاي آموزشي و کمک‌آموزشی
• بهینه‌سازی مصرف انرژي و استفاده از انرژی‌های تجديد پذير و نو
• افزايش ارائه خدمات به‌صورت الکترونيک و از طريق پرتال
• توسعه فناوری‌های اطلاعات از طريق سرمایه‌گذاری در زیرساخت‌های شبکه‌ای و ارتقاء نرم‌افزارها و سامانه‌ها
• اصلاح و بهبود فرايندهاي سازماني باهدف کوتاه‌سازی، روان‌سازی و چابك سازي فرآيندها
• واگذاری خدمات رفاهی دانشجويان از بدنه دانشگاه به بخش غیردولتی به‌منظور افزايش کارايی در امور آموزش، پژوهش و فناوری
• اصلاح ساختار و تمرکززدایی باهدف چابك سازي ساختار و حذف ساختارهاي زائد
• استقرار نظام بودجه‌ریزی عملياتی
• افزایش کار آیی و اثربخشی منابع مالي و اجرای مديريت هزینه‌ها
• کاهش اتکا به بودجه عمومی دولت از طريق تنوع‌بخشی و توسعه منابع مالی، بهره‌گیری از منابعی نظير وام، کمک خيرين و واقفين
• توسعه درآمدهای اختصاصی